Após cinco anos abrigando sentimentos não ditos, o ensino médio Taiju Ooki está finalmente pronto para confessar seu amor a Yuzuriha Ogawa. Quando Taiju começa sua confissão, no entanto, uma luz verde ofuscante atinge a terra e petrifica a humanidade ao redor do mundo - girando cada humano em pedra.
Vários milênios depois, Taiju acorda para achar o mundo moderno completamente inexistente, pois a natureza floresceu nos anos que a humanidade parou. Entre um mundo de estátuas de pedra, Taiju encontra um outro humano vivo: seu amigo amante da ciência Senkuu, que está ativo há alguns meses. Taiju descobre que Senkuu desenvolveu um grande esquema - para lançar o renascimento completo da civilização com a ciência. O Brawn de Taiju e os cérebros de Senkuu se combinam para forjar uma parceria formidável, e logo descobrem um método para reviver os petrificados.
No entanto, o plano diretor de Senkuu está ameaçado quando suas ideologias são desafiadas por aqueles que despertam. O tempo todo, a razão da petrificação da humanidade permanece desconhecida.